La investigación en la Facultad se desarrolla a partir del Núcleo Integrador, orientado a promover el conocimiento y la reflexión alrededor de las características y problemáticas de la música regional.

Desde esta temática se han derivado dos investigaciones en sentido estricto:

• Presencia y Esencia de la Mujer en la Música Santandereana en la Primera Mitad del Siglo XX 
• Causas que Obstaculizan el Desarrollo de la Música Popular Bailable en Bucaramanga y su Área Metropolitana

Es importante destacar la existencia del Centro de Documentación Musical 'Alejandro Villalobos Arenas', que se constituye en fuente de proyectos que bajo un concepto amplio de región, permita a mediano plazo integrar la labor investigativa al contexto contemporáneo latinoamericano.

Semillero de Investigación 'Los Músicos' 

Conformado por estudiantes del programa cuyo propósito es abrir y mantener un espacio para la exploración y el apoyo  a proyectos de investigación en sentido estricto que se presenten en la Facultad.

Actualmente desarrolla su trabajo sobre dos temáticas específicas:

• Patrimonio Musical 
• Músicas Populares Urbanas.

Es importante resaltar la participación del semillero de investigación 'Los Músicos' en los encuentros nacionales y regionales realizados respectivamente en: Pasto en 2005 y San Gil en 2006.