Nace en el año de 1996, dando soporte al convenio con el TEC Monterrey con el fin de desarrollar la investigación en la Maestría en Ciencias Computacionales, con la denominación de Laboratorio de Cómputo Especializado LCE, hoy Centro de Investigación en Ingeniería y Organizaciones. Sus primeros integrantes fueron profesores de la Facultad de Ingeniería de Sistemas.
En 1998, el centro fue calificado por Colciencias como un Centro de categoría C. Más tarde, en noviembre de 2000, en una nueva evaluación, fue elevado a Centro de categoría A (en el 15% más alto del escalafón).

El Centro de Investigación, en cooperación con la Facultad de Ingeniería de Sistemas de la UNAB, se encarga de la edición de la Revista Colombiana de Computación, que se publica semestralmente.

Los grupos adscritos al centro realizan investigación básica y aplicada en áreas del conocimiento relacionadas con ingeniería, participando en el desarrollo de proyectos multidisciplinares, en los cuales los fundamentos de ingeniería constituyen un eje central.